Przeskocz do nawigacji głównej Przeskocz do wyszukiwania Przeskocz do głównej treści

Gaussian mixture decomposition of time-course DNA microarray data

  • Rice University
  • Maria Sklodowska-Curie Institute of Oncology

Wyniki badań: Rozdział w książce/raport/materiał konferencyjnyRozdziałrecenzja

5 Cytowania z bazy Scopus

Abstrakt

In this chapter we present the decomposition approach to the analysis of large gene expression profile data sets. We address the problem of analysis of transient time-course data of expression profiles. We accept the assumption that co-expression of genes can be related to their belonging to the same Gaussian component. We assume that parameters of Gaussian components, means and variances, can differ between time instants. However, the gene composition of components is unchanged between time instants. For such problem formulations we derive the appropriate version of expectation-maximization algorithm recursions for the estimation of model parameters.We apply the derived method to the data on gene expression profiles of human K562 erythroleukemic cells and we discuss the obtained gene clustering.

Język oryginałuangielski
Tytuł publikacji goszczącejModeling and Simulation in Science, Engineering and Technology
WydawcaSpringer Basel
Strony351-359
Liczba stron9
Identyfikatory DOI
Status publikacjiOpublikowano - 2007

Seria publikacji

NazwaModeling and Simulation in Science, Engineering and Technology
Tom38
ISSN (drukowany)2164-3679
ISSN (elektroniczny)2164-3725

Obszary tematyczne ASJC Scopus

  • Modelowanie i symulacja
  • Inżynieria ogólna
  • Procesy przepływu i przenoszenia płynów
  • Matematyka obliczeniowa

Fingerprint

Zanurz się w tematy badawcze publikacji „Gaussian mixture decomposition of time-course DNA microarray data”. Razem tworzą niepowtarzalny odcisk palca.

Cytowanie